晶体结构的enoyl-acyl载体蛋白还原酶(FabK)肺炎链球菌揭示了抑制剂的绑定模式。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
齐藤J,山田M,渡边T, Iida M,北川H, Takahata年代,小泽T, Takeuchi Y,沢F
晶体结构的enoyl-acyl载体蛋白还原酶(FabK)肺炎链球菌揭示了抑制剂的绑定模式。
蛋白质科学。2008年4月,17 (4):691 - 9。doi: 10.1110 / ps.073288808。Epub 2008年2月27日。
- PubMed ID
-
18305197 (在PubMed]
- 文摘
-
Enoyl-acyl载体蛋白(ACP)还原酶是细菌II型脂肪酸生物合成的关键,因此有吸引力的目标,开发新型抗生素。我们确定enoyl-ACP还原酶的晶体结构(FabK)肺炎链球菌在1.7一项决议。有一个二聚体/不对称单位。每个亚基组成了一个磷酸丙糖异构酶(TIM)桶结构,和黄素单核苷酸(FMN)绑定作为辅因子的活性部位。整体结构类似于enoyl-ACP还原酶(ER)真菌脂肪酸合酶和2-nitropropane加双氧酶从铜绿假单胞菌(2日),尽管这些结构之间有一些差异。我们确定FabK的晶体结构在复杂phenylimidazole导数抑制剂想象绑定网站交互。晶体结构表明,疏水口袋里的抑制剂结合FabK的活性部位,这是伴随着诱导契合运动两个循环的地区。噻唑环和部分ureido抑制剂的一部分参与介子叠加一个面对面的交互FMN异咯嗪环的。拟议的催化残基的侧链构象,His144,变化复杂的形成。Lineweaver-Burk情节表明抑制剂结合竞争力对NADH和竞争力crotonoyl辅酶a .我们建议的主要基础抑制活动竞争NADH FabK绑定,这是第一步两步乒乓球催化机理。