结构的血管生成抑制剂ovalicin绑定到其非同源目标,人类1型甲硫氨酸氨肽酶。
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引用
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Addlagatta, Matthews BW
结构的血管生成抑制剂ovalicin绑定到其非同源目标,人类1型甲硫氨酸氨肽酶。
蛋白质科学。2006年8月,15 (8):1842 - 8。Epub 2006 7月5。
- PubMed ID
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16823043 (在PubMed]
- 文摘
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甲硫氨酸氨肽酶(metap)删除发起者在蛋白质生物合成蛋氨酸。他们存在于两个亚型,MetAP1 MetAP2。抗血管生成化合物烟曲霉素结合紧密的2型metap但只有弱1型。烟曲霉素的高亲和性复合物及其相对ovalicin 2型人类MetAP已报告。这里我们描述晶体结构之间的低亲和力复杂ovalicin 1.1和1型人类MetAP决议。这提供了第一个机会比较ovalicin或烟曲霉素的结构绑定到一个1型和2型技术。1型和2型人类metap抑制剂使共价加合物与相应的组氨酸。同时在抑制剂的一致性有显著差异在各自的活跃的网站。它一直认为低亲和力的ovalicin和烟曲霉素1型metap是由于规模较小的活跃的网站相对于2型酶。与人类的非复杂结构1型MetAP表明有一些道理。 Several active site residues have to move "outward" by 0.5 Angstroms or so to accommodate the inhibitor. Other residues move "inward." There are, however, other factors that come into play. In particular, the side chain of His310 rotates by 134 degrees into a different position where (together with Glu128 and Tyr195) it coordinates a metal ion not seen at this site in the native enzyme.