kink-turn:一个新的RNA二级结构的主题。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
克莱恩DJ, Schmeing TM、摩尔PB施泰茨助教
kink-turn:一个新的RNA二级结构的主题。
EMBO j . 2001年8月1;20(15):4214 - 21所示。
- PubMed ID
-
11483524 (在PubMed]
- 文摘
-
分析Haloarcula marismortui大核糖体亚基揭示了一个共同的RNA结构,我们称之为kink-turn,或K-turn。六个K-turns在H。marismortui 23 s rRNA重叠的r.m.s.d. 1.7。有两种结构的K-turns栖热菌属酸奶16 s rRNA, U4核内小rna的结构和L30e K-turns信使rna片段形式。磷酸二酯的结构有一个扭结骨干导致RNA螺旋的急转弯。其内部循环两侧不对称c g碱基对,一边剪g碱基对另一方面,这两个螺旋茎之间有一个小互动。派生的共识K-turn二级结构包括10共识核苷酸的15,并预测其在5 ' utr L10 mRNA,螺旋78在人类核糖核酸酶大肠杆菌23 s rRNA, MRP。五K-turns 23 s rRNA与9个蛋白质。而观察K-turns与蛋白质相互作用无关的结构在不同的方面,他们与L7Ae和两个同源蛋白质以同样的方式。