结构洞察肽键的形成。
文章的细节
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引用
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汉森JL Schmeing TM,摩尔PB,施泰茨助教
结构洞察肽键的形成。
《美国国家科学院刊a . 2002 9月3;99 (18):11670 - 5。Epub 2002年8月16日。
- PubMed ID
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12185246 (在PubMed]
- 文摘
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大型核糖体亚基催化肽键的形成,并将通过使用小型氨酰基- peptidyl-RNA tRNA的碎片。我们有精致的分辨率3 A的结构和P网站衬底和产品类似,以及一个中间模拟,绑定到Haloarcula marismortui 50 s核糖体亚基。P衬底,CCA-Phe-caproic acid-biotin,结合同样两个网站,但在稀疏霉素结合P网站。这些类似物的CCA部分是由一个或绑定相同P 23 s rRNA的循环。结合不同的P和底物复合物的网站为一个模型揭示了可能发生的交流时都同时存在。alpha-NH(2)群的aminoacylated片段网站形式一个氢键的N3 A2486(2451),可以形成第二个氢键2 A - 76的哦核糖P网站或2的哦的A2486 (2451)。这些交互位置附近α氨基羰基碳的网站酯化P衬底取向适合亲核攻击。