分子对接揭示了芬太尼在mu-阿片受体上的一种新的结合位点模型。

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萨勃拉曼尼亚G，帕特里尼MG，波托盖塞PS，弗格森DM

分子对接揭示了芬太尼在mu-阿片受体上的一种新的结合位点模型。

中华医学化学杂志2000 2月10日;43(3):381-91。

PubMed ID

10669565 (PubMed视图

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摘要

结合构象分析和与mu-阿片受体的分子对接，研究了一系列芬太尼衍生物的配体结合模式。冷凝相分子动力学模拟应用于评估配体构象和芬太尼取代之间的潜在关系，并为配体系列生成可能的“生物活性”结构。自动对接大量填充的溶液构象确定了一个共同的结合位点方向，将芬太尼的n -苯乙基置于跨膜(TM)螺旋II和III之间的缝隙深处，而n -苯丙酰胺基则指向由TM-III， -VI和-VII结构域形成的口袋。结合模式的分析表明，最有效的芬太尼衍生物在溶液和结合状态下都采用了扩展的构象，这表明结合亲和力可能取决于配体的构象偏好。该结果与从嵌合和突变受体研究中获得的配体结合数据以及广泛报道的芬太尼类似物的构效关系数据一致。结合位点模型也与n -苯乙基诺吗啡的结合位点模型进行了比较。阿片类药物和顺式3-甲基芬太尼结合构象的叠加显示n -苯基在受体中占据等效的结合域。虽然两种配体的阳离子胺都被发现停靠在一个固定的锚点上(TM-III中的D149)，但在n -苯丙酰胺组和阿片类支架的其余组分之间没有观察到重叠。为芬太尼系列提出的独特结合模式可能在一定程度上解释了在mu受体上定义识别模型时遇到的困难，并表明阿片受体可能显示多个结合表位。此外，这些结果为实验设计提供了新的见解，旨在了解mu-， delta-和kappa-阿片受体配体的差异选择性的结构基础。

beplay体育安全吗引用本文的药物库数据

药物靶点

药物	目标	种类	生物	药理作用	行动
3-Methylfentanyl	mu型阿片受体	蛋白质	人类	是的	受体激动剂	细节

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
3-Methylfentanyl	kappa型阿片受体	Ki (nM)	57.4	N/A	N/A	细节
3-Methylfentanyl	mu型阿片受体	Ki (nM)	0.02	N/A	N/A	细节
卡芬太尼	kappa型阿片受体	Ki (nM)	43.1	N/A	N/A	细节
卡芬太尼	mu型阿片受体	Ki (nM)	0.024	N/A	N/A	细节
芬太尼	kappa型阿片受体	Ki (nM)	196.5	N/A	N/A	细节
芬太尼	mu型阿片受体	Ki (nM)	3.97	N/A	N/A	细节