精确重建的出现和限制辐射大肠杆菌O157刻画成骨干concatenomic分析。
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利奥波德SR, Magrini V,霍尔特新泽西,谢赫N,狂欢节,Cagno J, Ogura Y,井口,Hayashi T, Mellmann, Karch H,贝瑟TE,索耶SA Whittam TS,塔尔π
精确重建的出现和限制辐射大肠杆菌O157刻画成骨干concatenomic分析。
《美国国家科学院刊S a . 2009年5月26日,106 (21):8713 - 8。doi: 10.1073 / pnas.0812949106。2009年5月13日Epub。
- PubMed ID
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19439656 (在PubMed]
- 文摘
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单核苷酸多态性(snp)稳定的基因组区域提供持久的物种进化的测量。我们系统地确定每个SNP串连的骨干orf 7新或之前完成进化意义的致病性大肠杆菌O157: H7, O157: H(-),和O55: H7。1113年同义snp展示出现最大的集群的病原体只有在最后一年。意外、共享snp限制集群内生物生存建议严格限制和有限的有效种群大小的致病性O157: H7,脆弱的这些生物的生存在自然界中,源库进化的动力,或者,可能有限数量的突变提供选择性的优势。一个大型段横跨rfb-gnd基因簇是唯一支柱地区令人信服地收购重组O55 O157出现。这concatenomic分析也支持使用单核苷酸多态性分化密切相关病原体感染控制和法医的目的。然而,限制辐射提高造假的可能性之间的联系隔离。