衬底结构基础和氧活化在Homoprotocatechuate 2中,3-Dioxygenase:角色的守恒的活性部位组氨酸200。
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Kovaleva如罗杰斯女士,以至于JD
衬底结构基础和氧活化在Homoprotocatechuate 2中,3-Dioxygenase:角色的守恒的活性部位组氨酸200。
生物化学。2015年9月1;54 (34):5329 - 39。doi: 10.1021 / acs.biochem.5b00709。Epub 2015年8月19日。
- PubMed ID
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26267790 (在PubMed]
- 文摘
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动力学和光谱研究表明的守恒的活性部位残留His200 extradiol ring-cleaving homoprotocatechuate 2, 3-dioxygenase (FeHPCD)从枯草芽孢fuscum对催化效率至关重要。这个角色扮演的残留物通过稳态动力学的分析,着重探讨了pH值依赖,200年FeHPCD位置和x射线晶体结构变异His200Asn, His200Gln,独自His200Glu和在复杂三catecholic基质(homoprotocatechuate、4-sulfonylcatechol 4-nitrocatechol)取代基具有不同的归纳能力。结构在1.35 - -1.75确定分辨率显示本质上没有改变整体活跃网站架构或衬底绑定模式对这些变体相比,野生型酶的结构及其类似的复合物。这表明最大50倍减少kcat环劈理,pH值依赖的戏剧性的变化,从环裂响氧化的4-nitrocatechol FeHPCD变体可以归结专门的属性改变第二方面残渣和衬底。结果表明催化质子转移是必要的,而且它发生时最高效的基质提供质子和His200作为催化剂。然而,在缺乏一个可用的衬底质子,质子转移路径定义的蛋白质可以利用。空间体积的变化和电荷的残留在200位置似乎能改变病原一步催化,也许,活性物种的本质。