识别和裂解位点的DNA序列分析绑定由博来霉素强烈。
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徐妈妈问,秋山Y, Z, Konishi K,赫克特SM
识别和裂解位点的DNA序列分析绑定由博来霉素强烈。
J是化学Soc。2009年2月11日,131(5):2013 - 22所示。doi: 10.1021 / ja808629s。
- PubMed ID
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19146404 (在PubMed]
- 文摘
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发夹DNA库包含一对8的原始sequence-randomized地区采用SELEX-type过程识别DNA强烈束缚博来霉素(5),后者是固定在一个坚实的支持。十个发夹DNA绑定BLM(5)强烈鉴定和测序,并用于描述DNA结合的抗肿瘤抗生素。虽然所有10个选择发卡dna绑定到BLM强烈,表现出一系列的结合特异性。进一步,结合特异性通常是最大的发夹dna包含至少一个序列(5“-GC-3”和5 -GT-3)裂解最频繁铁(II)。博来霉素,发夹的DNA表现出最穷的结合特异性还包含一个5“-GT-3”网站。四个发夹DNA基质的5 ' - (32)P end-labeled和用于评估的首选网站由铁(II) .BLM乳沟。底物dna包括两个没有任何“-GT-3”或5“-GC-3”网站;这些是裂解-AA-3和5点(更强烈)5 ' 3 ',5 ' -GA-3序列。两个发夹dna包含5“-GT-3”或5 -GC-3序列,乳沟也观察到这些序列,但前面所提到的三种序列也裂解效率。发夹DNA 3,这是最差的10个DNA研究,5“-TA-3”网站也裂解效率。因此,乳沟的模式和强度的四个DNA研究并不是完全一致的首选模式DNA乳沟铁(II)的报道。BLM在众多出版研究任意选择使用DNA基质。 Also studied were the chemistry of DNA cleavage for one of the hairpin DNAs, and competition experiments in which the diminution of cleavage was measured following admixture of a molar excess of a smaller hairpin DNA shown to be an exceptionally good substrate for cleavage by Fe(II).BLM. In the aggregate, the data indicate that the relationship between DNA binding and degradation by Fe.BLM, as well as the chemistry leading to DNA degradation, are more complex than suggested by earlier studies that employed only DNA degradation product analysis as an end point.