修改DNA适体结合萨力多胺衍生物(R)异构体的选择性高。
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Shoji, Kuwahara M, Ozaki H, Sawai H
修改DNA适体结合萨力多胺衍生物(R)异构体的选择性高。
J是化学Soc。2007年2月7日,129 (5):1456 - 64。
- PubMed ID
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17263432 (在PubMed]
- 文摘
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一个thalidomide-binding适体是由系统进化的指数富集配体库的非天然的DNA中胸苷被替换为修改后的脱氧尿苷轴承阳离子通过疏水亚甲基官能团链接器在C5的位置。额外的官能团在修改DNA适体可以提高稳定性萨力多胺对核酸酶,增加亲和力。选中的适配子可以识别萨力多胺拆分,虽然外消旋thalidomide-attached凝胶用于选择。表面等离子体共振荧光滴定研究显示,选择修改DNA适体和截断版本绑定(R)萨力多胺衍生物具有高选择性,但不是与(S)—构成。修改组的DNA适体与萨力多胺是必不可少的,作为相应的自然类型轴承相同的DNA碱基序列显示没有亲和力(R) -或(S)萨力多胺。计算序列分析表明,所选apatamer (108 mer)可以折叠成一个三方结结构;然而,截断的适配子(31 mer)透露,thalidomide-binding站点hairpin-bulge地区,是一个组件的一个武器的三方结结构。的Kd值截断31 mer适配子的绑定(R)萨力多胺衍生物是1.0 microM估计从荧光滴定法研究。可以识别单一对映体的适配子萨力多胺作为生化工具有用的分析和研究生物萨力多胺对映体的作用。