共价复合物的晶体结构与大肠杆菌penicillin-binding beta-lactam抗生素蛋白5:对抗生素特异性的理解。

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尼古拉G, Tomberg J,普拉特射频,尼古拉斯·拉戴维斯C

共价复合物的晶体结构与大肠杆菌penicillin-binding beta-lactam抗生素蛋白5:对抗生素特异性的理解。

生物化学。2010年9月21日,49 (37):8094 - 104。doi: 10.1021 / bi100879m。

PubMed ID

20726582 (在PubMed

]

文摘

Penicillin-binding蛋白质(是)是广泛使用的分子靶点beta-lactam类的抗生素,但这些化合物在分子水平上并不完全理解。我们已经确定晶体结构的大肠杆菌PBP 5与imipenem共价复合物,氯唑西林和头孢西丁。这些抗生素表现出截然不同的二阶的酰化酶。在所有的三个结构,有良好的电子密度的中央部分beta-lactam,但薄弱或缺乏R1和R2侧链的密度。地区之间的接触抗生素和PBP 5不与酰化的利率。构象的变化也是如此,因为尽管转变的一个循环导致Arg248之间的静电相互作用和beta-lactam羧酸盐,发生完全与头孢西丁和部分imipenem和邻氯青霉素缺席,符合不同的酰化、诱变的Arg248降低头孢西丁酰化只有2倍的水平。在一起,这些数据表明,postcovalent复合物结构PBP 5不太可能有用的汽车是新的共价抑制剂的设计。最后,叠加imipenem-acylated复杂PBP 5在复杂boronic酸peptidomimetic显示相对应的位置水解水分子由beta-lactam环氮的阻挡。因为环氮占据了一个类似的位置在所有三个复合物,这支持了假设脱酰作用被持续存在的离去基团打开后beta-lactam戒指。

beplay体育安全吗DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
邻氯青霉素	D-alanyl-D-alanine羧肽酶DacA	蛋白质	大肠杆菌(应变K12)	是的	抑制剂	细节