半胱氨酸是催化的通用基础服务由3-nitropropionate异柠檬酸裂解酶和抑制机理。
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莫伊尼汉MM, Murkin
半胱氨酸是催化的通用基础服务由3-nitropropionate异柠檬酸裂解酶和抑制机理。
生物化学。2014年1月14日,53 (1):178 - 87。doi: 10.1021 / bi401432t。Epub 2013年12月24日。
- PubMed ID
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24354272 (在PubMed]
- 文摘
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异柠檬酸裂解酶(ICL)催化异柠檬酸为琥珀酸和乙醛酸的可逆的乳沟。它是第一个关键步骤在乙醛酸循环使用的一些有机体,包括结核分枝杆菌,它已被证明是在慢性感染细胞生存所必需的。ph值和pD-rate概要文件以异柠檬酸合成的方向显示溶剂动力学同位素效应(黄铁矿)的(D2O) 1.7 + / - 0.4 V和0.56 + / - 0.07 (D2O) (V / Ksuccinate)。而(D2O) V是符合部分病原质子转移过程中形成的羟基异柠檬酸,大型逆(D2O) (V / Ksuccinate)表明,当酶显著不同的动力学参数存在饱和与琥珀酸。琥珀酸抑制3-nitropropionate (3-NP)模拟,发现一个不寻常的双缓慢发作过程中形成的一个复杂的Ki 3.3 + / - 0.2妈妈在第一分钟,其次是最终形成复杂的Ki * 44 + / - 10 nM在几分钟到几小时。Stopped-flow测量在第一分钟显示一个明显的溶剂KIE 0.40 + / - 0.03为离解协会和团结。相比之下,itaconate,琥珀酸类似物缺乏酸性质子,没有显示slow-binding行为和产生(D2O) Ki为1.0 + / - 0.2。这些结果支持一个共同的机制与琥珀酸催化和抑制3-NP特色(1)预绑定的异构化活性部位的不利Cys191-His193 thiolate-imidazolium形式,这一过程是D2O青睐,和(2)一个质子的转移从琥珀酸或3-NP Cys191。这些发现还表明,propionate-3-nitronate的共轭碱3-NP ICL的“真正的抑制剂”,不直接绑定,必须保持酶的生成。