从结核分枝杆菌嘌呤核苷磷酸化酶复合物结构与immucillin-H及其碎片。
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施W,低音部,桑托斯DS,泰勒PC,福尔诺RH忙于打捞收拾悉尼湾号,布兰查德JS, Almo SC,施拉姆六世
从结核分枝杆菌嘌呤核苷磷酸化酶复合物结构与immucillin-H及其碎片。
生物化学。2001年7月27日,40(28):8204 - 15所示。
- PubMed ID
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11444966 (在PubMed]
- 文摘
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结构基因组学的比较嘌呤核苷磷酸化酶(pnp)表明,结核分枝杆菌的酶编码(TB-PNP)类似于哺乳动物的三聚物的结构而不是细菌hexameric pnp型。结核分枝杆菌PNP型的晶体结构复杂的过渡态类似物immucillin-H (ImmH)和无机磷酸盐在1.75一项决议,确认解决三聚物的结构。绑定抑制剂发生独立的三个催化网站,不像哺乳动物pnp型展示负协同ImmH绑定。减少单元接口联系人TB-PNP,而哺乳动物的酶,与合作的损失抑制剂具有约束力。哺乳动物和TB-PNPs展览起病缓慢抑制和picomolar ImmH离解常数。反应物的结构支持催化机理由邻近组织静电相互作用不稳定,过渡态的稳定与离去基团激活。尽管整体氨基酸序列的身份33%牛和TB-PNPs之间几乎完全保护在活性位点残基,一个催化部位的区别表明战略为TB-PNP设计过渡态类似物的特异性。TB-PNP也解决的结构与9-deazahypoxanthine 2.0 (9 dhx), iminoribitol (IR)和PO(4)重建ImmH复杂的单独的组件。三聚体的一个亚基9 dhx,红外光谱、和PO(4)绑定,而剩下的两个子单元只包含9 dhx。在亚基,9 dhx保留ImmH复杂中的联系人。 However, the region of IR that corresponds to the oxocarbenium ion is translocated in the direction of the reaction coordinate, and the nucleophilic phosphate rotates away from the IR group. Loose packing of the pieces of ImmH in the catalytic site establishes that covalent connectivity in ImmH is required to achieve the tightly bound complex.