碳酸氢盐代数余子式调节1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-coenzyme合酶在大肠杆菌的甲基萘醌类的生物合成。
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陈姜米,M,郭郭ZF, Z
碳酸氢盐代数余子式调节1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-coenzyme合酶在大肠杆菌的甲基萘醌类的生物合成。
J生物化学杂志。2010年9月24日,285 (39):30159 - 69。doi: 10.1074 / jbc.M110.147702。Epub 2010年7月19日。
- PubMed ID
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20643650 (在PubMed]
- 文摘
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1,4-Dihydroxy-2-naphthoyl辅酶A合成酶(DHNA-CoA)是一个典型的crotonase-fold蛋白质的分子内克莱森缩合催化甲基萘醌类生物合成途径。我们有这种酶的大肠杆菌的特征,发现它是由碳酸氢盐浓度的方式激活。碳酸氢盐结合位点已被确认的晶体结构几乎相同的直接同源序列的身份)(96.8%鼠伤寒沙门氏菌通过与bicarbonate-insensitive orthologue。酶及其基因定点突变体的动力学属性的重碳酸盐结合位点表明,外生碳酸氢盐离子对酶活性至关重要。与这个重要的催化作用,简单的重碳酸盐离子是酶辅助因子,这通常是一个小有机分子来源于维生素、金属离子或含金属多元复杂阴离子。DHNA-CoA合成酶的这一发现会导致分类为两个进化保守的亚科:I型酶bicarbonate-dependent和包含碳酸氢盐的守恒的甘氨酸结合位点;和II型酶bicarbonate-independent和包含一个守恒的天冬氨酸类似enzyme-bound碳酸氢盐的位置。此外,独特的位置enzyme-bound碳酸氢盐可以作为催化基地负责提出抽象的质子硫酯酶的底物反应,建议统一为所有DHNA-CoA合成酶催化机理。