竞争性抑制剂的结核分枝杆菌ribose-5-phosphate异构酶B揭示新的反应机理的信息。beplayapp
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鲁斯AK,布尔戈斯E,爱立信DJ,鲑鱼L,莫布雷SL
竞争性抑制剂的结核分枝杆菌ribose-5-phosphate异构酶B揭示新的反应机理的信息。beplayapp
J生物化学杂志。2005年2月25日,280(8):6416 - 22所示。Epub 2004年12月7日。
- PubMed ID
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15590681 (在PubMed]
- 文摘
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Ribose-5-phosphate异构酶(Rpi)、磷酸戊糖途径中的一个重要的酶,催化二磷酸核5-phosphate互变现象和核糖5-phosphate。两个不相关的异构酶识别,RpiA RpiB,不同的结构和活性位点残基。催化反应的酶被认为通过高能enediolate中间进行,以此类推到其他碳水化合物异构酶。我们现在一起研究结核分枝杆菌的RpiB小分子设计类似于enediolate中间。这些抑制剂的相对亲和力RpiB有不同的模式比先前观察到的RpiA菠菜。x射线结构在复杂RpiB抑制剂4-phospho-d-erythronohydroxamic酸(K (m) 57 microm)和4-phospho-d-erythronate (K (i) 1.7毫米)精制决议的2.1和2.2,分别为最活跃的站点允许我们分配角色残留。这些结果,结合对接基板的位置最有效的抑制剂,现在让我们来概述RpiBs的反应机理。酶都有残留,可以促进开放的呋喃糖环核糖5-phosphate所以可以提高反应的效率。两种酶也有酸性渣,作为基地的异构化的步骤。赖氨酸残基在RpiAs提供了更高效的稳定的中间比相应的卸货RpiBs组; this same feature lies behind the more efficient binding of RpiA to 4-phospho-d-erythronate.