晶体结构的假定的结核分枝杆菌的甲基转移酶:misannotation基因组澄清的蛋白质结构分析。
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约翰斯顿JM Arcus六世,莫顿CJ,帕克MW,贝克
晶体结构的假定的结核分枝杆菌的甲基转移酶:misannotation基因组澄清的蛋白质结构分析。
J Bacteriol。2003年7月,185 (14):4057 - 65。
- PubMed ID
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12837779 (在PubMed]
- 文摘
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全基因组序列的生物信息学分析突出的问题识别许多基因的生化和细胞功能的产品目前无特征。开放阅读框Rv3853结核分枝杆菌被注释为孟和假定编码一个S-adenosylmethionine (SAM)端依赖甲基转移酶催化甲基萘醌类生物合成的最后一步。Rv3853基因产物的表达,复合,纯化和结晶的结构基因组学计划。其晶体结构由同形替换和精制分辨率1.9 R因子的19.0%和22.0%的R(免费)。强烈表明,这种蛋白质结构不是一个SAM-dependent甲基转移酶和基因被misannotated和其他含有同源染色体基因组。蛋白质形成一个紧密相关,盘状三聚物。单体褶皱是不同于任何已知的SAM-dependent甲基转移酶,最接近类似phosphohistidine域的几个phosphotransfer系统。试图结合代数余子式和底物分子已经成功,但两个偶然地结合小分子配体,建模为酒石酸和glyoxalate,存在在每个单体。这些可能指向生物相关的结合位点,但不建议一个函数。在硅片筛选显示一系列的配体,可以占领这些和其他网站。 The nature of these ligands, coupled with the location of binding sites on the trimer, suggests that proteins of the Rv3853 family, which are distributed throughout microbial and plant species, may be part of a larger assembly binding to nucleic acids or proteins.