晶体结构的结核分枝杆菌dUTPase:洞察催化机制。
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陈,Segelke B, Lekin T,克鲁普卡市H,赵,金正日,M, Kim CY Naranjo厘米,罗杰斯YC,公园女士,Waldo GS,帕什科夫,卡西欧D,佩里杰·萨瓦亚先生的
晶体结构的结核分枝杆菌dUTPase:洞察催化机制。
J杂志。2004年8月6日,341(2):503 - 17所示。
- PubMed ID
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15276840 (在PubMed]
- 文摘
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结核分枝杆菌的结构dUTP nucleotidohydrolase (dUTPase)已经被确定为1.3埃分辨率与镁离子和non-hydrolyzable基体复杂的模拟,α,beta-imido dUTP。dUTPase枯竭是一种重要的潜在的有毒浓度的dUTP细胞。鉴于其生物作用的重要性,提出了抑制M。肺结核dUTPase可能是一个有效的方法来治疗结核病感染人类。这里介绍的晶体结构为潜在的设计提供了一些见解的特定抑制剂。肺结核dUTPase酶。结构还提供了新的见解dUTP水解的机理提供了一个精确的表示的es复杂金属离子和dUTP模拟都包括在内。结构表明,包含一个镁离子是重要的稳定的位置alpha-phosphorus内联亲核攻击。在缺乏镁,alpha-phosphate dUTP可以有两个位置的相差4.5埃。暂时性的命令c端循环进一步协助催化屏蔽一般基础,Asp83,从溶剂从而提升其pK(一个),这样它可能反过来激活紧密地绑定水分子亲核攻击。金属离子坐标α、β和γ磷酸基与观察有三齿的几何形状相同的DNA聚合酶的晶体结构β与镁和核苷酸模拟,揭示催化机理的一些共同的特征。