apo-neocarzinostatin的三维解决方案结构。
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apo-neocarzinostatin的三维解决方案结构。
J杂志。1992年5月5日,225 (1):125 - 35。
- PubMed ID
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1533878 (在PubMed]
- 文摘
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两个解决方案和三维核磁共振研究11 k脱辅基蛋白的天然抗肿瘤剂neocarzinostatin (nc)扩展到高分辨率结构的说明使用抑制分子动力学计算。精细结构达到收敛迭代计算三个步骤后,在从实验数据中提取更多的距离限制,和现有的距离范围进行优化的基础上计算结构。apo-NCS的解决方案结构包含七个反平行的beta-strands,形成两个密切位于β折叠和一个短beta-segment。这种蛋白质缺乏任何α螺旋的组件。七beta-strands产生的对齐beta-barrel细长的直径在一个方向上。全球apo-NCS结构类似于Ig-fold领域中发现的免疫球蛋白和其他β蛋白相关的结构。残基侧链负责包装和可能的盐桥形成重要的蛋白质折叠中被确认。Neocarzinostatin已知和类似的蛋白质发挥其生物活性通过DNA与发色团的分子之间的相互作用,这是共价绑定到载脂蛋白。这个分子chromophore-binding网站apo-NCS由空腔组成的残留beta-segment four-beta-stranded表和短。尽管apo-NCS的解决方案结构类似于类似apoauromomycin结晶状态,不同形状的两者之间的绑定蛀牙。 This study provides a structural basis for characterization of the specific recognition and molecular mechanism of the antitumor NCS chromophore binding to its host protein.