酰基载体蛋白的三维结构由NMR pseudoenergy和距离几何计算。
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Holak助教,Kearsley SK,金正日Y, Prestegard JH
酰基载体蛋白的三维结构由NMR pseudoenergy和距离几何计算。
生物化学。1988年8月9日,27日(16):6135 - 42。
- PubMed ID
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3056520 (在PubMed]
- 文摘
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距离约束的二维核磁共振交叉衰减数据被用来获得酰基载体蛋白的三维结构大肠杆菌。一些结构测定方法探讨。最成功的是一个方法,结合了几何距离项目的早期阶段和能量最小化的NMR约束表示为伪势。大约450个质子质子距离约束包括50名远程约束被包含在这些项目。开始距离几何结构随机生成的程序通过分子力学和能量最小化模块给最终的结构。7的结构被认为可接受的协议与实验的基础上确定距离。均方根偏差的意思是这些结构骨架原子的范围从2到3。所有结构显示三个大致平行的螺旋向内和向外亲水残基面临面临疏水残基。疏水裂是辨认和识别作为酰基链可能绑定。