遗传多样性和缺乏的恶性疟原虫青蒿素选择签名ATP6在大湄公河次区域。
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王苗族M, Z,杨Z,元L,帕克DM, Putaporntip C, Jongwutiwes年代,Xangsayarath P, Pongvongsa T门司H, Dinh盯上了T,安倍T, Nakazawa年代,觉MP,燕G, Sirichaisinthop J, Sattabongkot J,μJ,苏XZ,金子啊,崔L
遗传多样性和缺乏的恶性疟原虫青蒿素选择签名ATP6在大湄公河次区域。
《公共科学图书馆•综合》。2013;8 (3):e59192。doi: 10.1371 / journal.pone.0059192。Epub 2013年3月26日。
- PubMed ID
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23555629 (在PubMed]
- 文摘
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最近检测临床耐青蒿素(ART)表现为延迟寄生虫间隙在柬泰边境地区引发了一个严重的问题。艺术耐药性的机制还不清楚;但恶性疟原虫石棺/内质网钙(2 +)腺苷三磷酸酶(PfSERCA或PfATP6)被推测是艺术的目标,因此潜在的标志艺术阻力。这里我们放大和测序pfatp6基因(~ 3.6 Kb) 213年从大湄公河次区域样本收集了2005年之后,在过去ART药物已被广泛使用。共有24个单核苷酸多态性(snp),包括8新发现在这项研究中,13产生的,被确定。然而,这些突变是罕见或也出现在其他地理区域有限的艺术使用。没有突变暗示定向选择的艺术。我们进一步分析pfatp6从862年世界范围内的恶性疟原虫在19个种群隔离来自亚洲,非洲,南美洲和大洋洲,包括样本地区部署ART药物之前和之后。总共71个snp,导致106核苷酸单。同样,许多突变continent-specific和出席频率低于5%。 The most predominant and perhaps the ancestral haplotype occurred in 441 samples and was present in 16 populations from Asia, Africa, and Oceania. The 3D7 haplotype found in 54 samples was the second most common haplotype and present in nine populations from all four continents. Assessment of the selection strength on pfatp6 in the 19 parasite populations found that pfatp6 in most of these populations was under purifying selection with an average d(N)/d(S) ratio of 0.333. Molecular evolution analyses did not detect significant departures from neutrality in pfatp6 for most populations, challenging the suitability of this gene as a marker for monitoring ART resistance.