齐聚反应的结构域的Lsr2结核分枝杆菌显示染色体组织和保护机制。
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萨默斯EL, Meindl K,塞缪尔,Mitra AK, Radjainia M, Colangeli R, Alland D, Arcus六世
齐聚反应的结构域的Lsr2结核分枝杆菌显示染色体组织和保护机制。
《公共科学图书馆•综合》。2012;7 (6):e38542。doi: 10.1371 / journal.pone.0038542。Epub 2012年6月13日。
- PubMed ID
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22719899 (在PubMed]
- 文摘
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Lsr2是一个小的dna结合蛋白存在于分枝杆菌和相关的放线菌,调节基因表达和影响细菌染色质的组织。Lsr2二聚体,结合at富集区的染色体DNA和身体保护DNA免受活性氧中间体(ROI)的影响。最近Lsr2 c端DNA结合域的结构提供了一个理由与DNA小沟的互动,其偏爱at富集地区,其他细菌nucleoid-associated DNA结合域的相似性。相比之下,的细节Lsr2二聚(和寡聚化)通过其n端结构域,Lsr2-mediated染色体交联的机理和保护是未知的。我们已经解决了n端结构域的结构Lsr2 (N-Lsr2)分辨率1.73使用晶体从头开始的方法。显示了一个亲密的二聚体结构的两个ss-ss-a图案没有关闭同系物的结构数据库。组织个人N-Lsr2晶体的二聚体也揭示了一个齐聚反应的机制。蛋白水解切除三氨基端残留Lsr2导致相邻分子之间形成一个反平行β褶板和N-Lsr2的线性链的形成。寡聚化可以使用低浓度胰蛋白酶和人工诱导N-Lsr2为长链的排列是观察到的单斜和六角晶体的空间群。在溶液中,寡聚化N-Lsr2也观察到后用胰蛋白酶处理。 A change in chromosomal topology after the addition of trypsin to full-length Lsr2-DNA complexes and protection of DNA towards DNAse digestion can be observed using electron microscopy and electrophoresis. These results suggest a mechanism for oligomerization of Lsr2 via protease-activation leading to chromosome compaction and protection, and concomitant down-regulation of large numbers of genes. This mechanism is likely to be relevant under conditions of stress where cellular proteases are known to be upregulated.