Supergenomic网络压缩和发现EXP1青蒿琥酯的谷胱甘肽转移酶抑制。
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Lisewski,奎洛斯JP, Ng CL, Adikesavan AK,三浦K, Putluri N,伊士曼RT, Scanfeld D,发起SJ, Altenhofen L, Llinas M, Sreekumar A, C, Fidock哒,Lichtarge O
Supergenomic网络压缩和发现EXP1青蒿琥酯的谷胱甘肽转移酶抑制。
细胞。2014年8月14日,158 (4):916 - 28。doi: 10.1016 / j.cell.2014.07.011。
- PubMed ID
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25126794 (在PubMed]
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生物学中一个核心问题是确定基因功能。一种方法是在大型supergenomic网络推断函数的交互和祖先的基因之间的关系;然而,他们的分析可以计算的。我们在这里展示,这些生物网络是可压缩的。它们可以显著减少通过消除冗余的进化关系,这个过程是有效的,因为在这些网络可压缩元素的数量直线上升,而不是指数和其他复杂的网络。压缩使全球网络分析计算利用数以百计的相互关联的基因组和生产功能预测。作为一个演示中,我们表明,必要的,但功能但一个个恶性疟原虫抗原EXP1膜谷胱甘肽S-transferase。EXP1有效地降低细胞毒性血色素,强有力地抑制了青蒿琥酯,并与drug-pressured疟原虫青蒿琥酯代谢和易感性有关。这些数据表明EXP1在前线抗疟药物的作用方式。