结构内的弹性基础(TMC114)抵抗hiv - 1蛋白酶的主要皮瓣突变。

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Purohit R, Sethumadhavan R

结构内的弹性基础(TMC114)抵抗hiv - 1蛋白酶的主要皮瓣突变。

Interdiscip Sci。2009年12月,1 (4):320 - 8。doi: 10.1007 / s12539 - 009 - 0043 - 8。Epub 2009年11月14日。

PubMed ID

20640812 (在PubMed

]

文摘

理解的起源明显低灵敏度Darunavir突变展出,这对hiv - 1蛋白酶抑制剂的结合能量进行了研究。我们的研究表明,观测到的有效性对野生型内hiv - 1蛋白酶是由于非常高亲和力对野生型和相对温和的影响I50V和I54M突变是由于低亲和力的抑制剂。良好的亲和力Darunavir占好了住宿的添加剂影响结合位点,好中的静电和范德瓦耳斯能源,低敏感性I50V和I54M可以合理化方面的灵活性结合位点残留,不允许药物住宿结合位点突变造成的扭曲。主要的皮瓣I50V突变和I54M降低Darunavir通过改变的亲和力结合位点的位置在3 d空间中残留。它减少静电和范德瓦耳斯相互作用能和进一步减少总receptor-ligand交互能量。结果总结了本文强调形状互补的重要性和蛋白质分析绑定残余相互作用的药物设计灵活性。这些数据与相互作用能和灵活性分析建立了严格的指导方针,设计新的、更强大的抑制剂。原则从hiv - 1蛋白酶可以应用于其他设计问题。

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