大肠杆菌贱人脯氨酸脱氢酶域的结构复杂的竞争性抑制剂。
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张,白色的助教,时间JP, Baban英航,贝克尔DF,坦纳JJ
大肠杆菌贱人脯氨酸脱氢酶域的结构复杂的竞争性抑制剂。
生物化学。2004年10月5日,43 (39):12539 - 48。doi: 10.1021 / bi048737e。
- PubMed ID
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15449943 (在PubMed]
- 文摘
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脯氨酸脱氢酶(PRODH)催化第一步的脯氨酸代谢,脯氨酸的flavin-dependent氧化δ(1)-pyrroline-5-carboxylate。在这里,我们提出一个基于结构的研究PRODH多功能大肠杆菌利用脯氨酸的活性部位(婊子)蛋白质使用x射线晶体学,酶动力学测量和定点诱变。贱人PRODH域的结构与竞争抑制剂醋酸(K (i) = 30毫米),L-lactate (K (i) = 1毫米),和L-tetrahydro-2-furoic酸(L-THFA K (i) = 0.2毫米)已被认定为高分辨率的极限2.1 - -2.0。醋酸作为竞争抑制剂的发现表明,羧基是最低官能团被活跃的网站,展示酶利用氢键的结构和极性交互优化底物的亲和力。PRODH / L-THFA PRODH结构复杂是第一个与五元环脯氨酸模拟结合的活性位点,从而提供了新的见解底物识别和催化机制。L-THFA几乎平行的环中间时尚异咯嗪环,与时尚的抑制剂C5 atom 3.3它们。这个几何表明直接氢化物转移作为一个合理的机制。突变的守恒的活性部位残留Leu432 Pro造成5倍降低k(猫)和热稳定性严重损失。这些变化是一致的的位置附近的疏水核心Leu432残留直接接触时尚。我们的研究结果表明,等离子体脯氨酸含量增加精神分裂症的分子基础研究对象携带错义突变L441P是由于人类PRODH2的稳定性下降。