描述在枯草芽孢杆菌aminoacyl-adenylates tryptophanyl-tRNA合成酶,色氨酸荧光的类似物5-hydroxytryptophan 7-azatryptophan。

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霍格CW,萨博AG)

描述在枯草芽孢杆菌aminoacyl-adenylates tryptophanyl-tRNA合成酶,色氨酸荧光的类似物5-hydroxytryptophan 7-azatryptophan。

Biophys化学。1993年12月,48 (2):159 - 69。0301 - 4622 . doi: 10.1016 / (93) 85007 - 5。

PubMed ID
8298054 (在PubMed
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色氨酸类似物5-hydroxytryptophan (5 hw)和7-azatryptophan (7 aw)能够被biosynthetically纳入细菌蛋白质和可以作为固有荧光探针的蛋白质结构、功能和动态。模拟合并的先决条件是他们认识到tryptophanyl-tRNA合成酶(TrpRS)和模拟aminoacyladenylate的形成酶的活性部位。绑定5 hw和7 aw的枯草芽孢杆菌TrpRS和相应的稳定aminoacyladenylates 5 hw和7 aw检查用他们独特的光谱特性。7 aw的腺苷酸的活性部位TrpRS表现出强烈的荧光,10.5 ns荧光衰减时间。Enzyme-bound 7 aw-adenylate是个长寿的中间,超过9小时的半衰期。Enzyme-bound 5 hw-adenylate荧光猝灭比5 hw的解决方案。5 hw-adenylate / TrpRS复杂不稳定得多比7啊,半衰期为33分钟。的快速水解5 hw-adenylate可以解释观察到的明显的校对,禁止5 hw并入蛋白质色氨酸的存在。水解的腺苷酸类似物恢复荧光参数对这两个类似的解决方案。无论是1-methyltryptophan还是5-methoxytryptophan能够形成长期aminoacyladenylate TrpRS中间体。 This study provides perspectives on the usefulness of 5HW and 7AW as intrinsic fluorescence probes of protein structure. The enhanced fluorescence of 7AW suggests its location in a buried hydrophobic environment in the protein. Exposure to water results in significant fluorescence quenching. These studies clearly demonstrate the utility of Trp analogs for the elucidation of molecular details of protein structure and dynamics.

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药物靶点
药物 目标 生物 药理作用 行动
羟色氨酸 色氨酸——tRNA连接酶2 蛋白质 耐辐射球菌(写明ATCC 13939株/ DSM JCM 16871 /液化沼气20539 / 4051 / 15346 / NCIMB NBRC 9279 / R1 / VKM b - 1422)
未知的
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