特异性氨基糖苷-核糖体相互作用在抑制翻译中的作用。
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李颖，朱海华，邵纪，郭志强
特异性氨基糖苷-核糖体相互作用在抑制翻译中的作用。
RNA。2019年2月,25(2):247 - 254。doi: 10.1261 / rna.068460.118。Epub 2018 11月9日。
- PubMed ID
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30413565 (PubMed视图］
- 摘要
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含有2-脱氧链霉素核心(AGs)的氨基糖苷代表了一大类靶向核糖体的抗生素。这些化合物促进编码错误，抑制易位，抑制核糖体循环。AG结合到小亚基的螺旋h44上，诱导a位点核苷酸A1492和A1493的重排，这促进了亚基关键的开闭构象变化，从而增加了误编码。ag抑制转运和循环的机制尚不清楚。结构研究揭示了在H69的大亚基中有一个AG的二级结合位点，并提出该位点的相互作用对于抑制转位和循环至关重要。在这里，我们分析了以AG结合位点之一或两个位点为靶点的突变核糖体。在易位分析中，我们发现切除h44位点显著增加了AGs的IC50值，而去除H69位点则略微增加了这些值。这表明AG-h44的相互作用主要是抑制作用，H69起着次要作用。通过循环分析，我们发现h44突变对AG抑制没有影响，这与AG- h69相互作用的主要作用一致。总的来说，这些发现有助于阐明两个AG结合位点在这些化合物抑制机制中的作用。