属于LexA识别额外的基因在大肠杆菌调节子。
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费尔南德斯•Henestrosa AR,奥吉T, Aoyagi年代,Chafin D,海耶斯JJ, Ohmori H,伍德盖特R
属于LexA识别额外的基因在大肠杆菌调节子。
摩尔Microbiol。2000年3月,35 (6):1560 - 72。doi: 10.1046 / j.1365-2958.2000.01826.x。
- PubMed ID
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10760155 (在PubMed]
- 文摘
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曝光的大肠杆菌dna有害结果的各种感应的全球“SOS反应”。许多基因的表达在SOS调节子控制的LexA蛋白质。LexA充当这些分离的基因的转录阻遏绑定到特定的序列(LexA框)位于每个LexA-regulated基因的启动子区域。对齐20 LexA结合位点中发现大肠杆菌染色体显示5的共识”-TACTG (TA) 5 cagta-3”。DNA序列,表现出非常接近的共识是一个低异体构造指数和LexA紧密结合,而那些更分化有很高的异体构造指数和预计不会绑定LexA。通过使用这个异体构造索引,连同其他搜索标准,如公认的LexA框的位置相对于基因和启动子元素,我们执行计算搜索整个大肠杆菌的基因组发现小说LexA-regulated基因。这些搜索确定69潜在LexA-regulated /操纵子基因与异体构造指数< 15和包括所有先前LexA-regulated特征基因。探测了其余的基因,这些被北方分析筛选damage-inducible基因表达野生型lexA +细胞,组成型表达在lexA (Def)细胞和基底表达non-inducible lexA(印第安纳州)细胞。这些实验让我们识别七个新LexA-regulated基因,从而使目前的基因在大肠杆菌LexA 31日调节子。每一个新发现的势函数LexA-regulated基因进行了探讨。