应用程序的对接和QM / MM-GBSA改屏幕小说Myt1激酶抑制剂。

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Wichapong K, Rohe Platzer C, Slynko我Erdmann F,施密特M, Sippl W

应用程序的对接和QM / MM-GBSA改屏幕小说Myt1激酶抑制剂。

J化学正模型。2014年3月24日,54 (3):881 - 93。doi: 10.1021 / ci4007326。Epub 2014年2月13日。

PubMed ID

24490903 (在PubMed

]

文摘

鉴定化合物可以绑定一个靶蛋白的高亲和力是一个重要的任务在基于结构的药物设计。几种方法从简单的评分方法要求更多的计算方法通常是用于这一目的。在当前的工作中,我们使用配体对接结合QM / MM-GBSA MM-GBSA, MM-PBSA改区分活跃的和不活跃的Myt1激酶抑制剂。结果表明,QM / MM-GBSA改执行比正常对接成绩或MM-GBSA改分类活跃的和不活跃的抑制剂。我们还应用QM / MM-GBSA改估计绑定亲和力不同虚拟筛选的化合物。证明我们的方法及其预测能力确认,一些化合物是预测积极购买和实验测试。选择5个化合物中,三个重组Myt1显示显著的抑制作用。pd - 173952,取得了良好的QM / MM-GBSA绑定自由能,显示K (i) 8.1 nM的价值。此外,两种化合物,pd - 180970和saracatinib,显示抑制在微摩尔的较低水平。因此,进一步的开发协议可能有用虚拟筛选实验更好的区分活跃的和不活跃的化合物和进一步优化确定。

beplay体育安全吗DrugBank数据引用了这篇文章

药物

pd - 173952