识别的基因签名pre-transformation过程在正常的人类表皮角化细胞衰老逃税。

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马丁·N Salazar-Cardozo C, Vercamer C,奥特L,马罗特G, Slijepcevic P, Abbadie C, Pluquet O

识别的基因签名pre-transformation过程在正常的人类表皮角化细胞衰老逃税。

摩尔癌症。2014年6月14日,13:151。doi: 10.1186 / 1476-4598-13-151。

PubMed ID

24929818 (在PubMed

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文摘

背景:流行病学数据显示,癌的发病率在人类高度依赖的年龄。然而,最初的步骤与年龄相关的分子致癌过程的开关向肿瘤发生状态仍然知之甚少,主要是由于缺乏强大的模型。在先前的研究中,我们表明,正常的人类表皮角化细胞(这些)自发地和系统地逃离新兴细胞衰老引起肿瘤前期。方法:在这里,这个模型被用来分析相关的基因表达谱与年龄相关的细胞的早期步骤转换。我们比较基因表达谱的增长或衰老这些post-senescent新兴细胞。数据分析采用线性建模的特点limma包,导致双边t测试或基于主持群野生的统计数据。的假定值调整为多个测试通过控制错误发现率根据Benjamini业务方法。常见的基因集产生的这两个差异基因表达谱的比较显示post-senescence肿瘤出现(PSNE) 286个基因的基因签名。结果:大约一半的这beplayapp些基因已经报告为参与癌症或癌变前的皮肤疾病。然而,生物信息学分析没有强调在这个签名规范化癌症通路但代谢途径,包括在第一行细胞色素P450的外源性物质的代谢。 In order to validate the relevance of this signature as a signature of pretransformation by senescence evasion, we invalidated two components of the metabolism of xenobiotics by cytochrome P450, AKR1C2 and AKR1C3. When performed at the beginning of the senescence plateau, this invalidation did not alter the senescent state itself but significantly decreased the frequency of PSNE. Conversely, overexpression of AKR1C2 but not AKR1C3 increased the frequency of PSNE. CONCLUSIONS: To our knowledge, this study is the first to identify reprogrammation of metabolic pathways in normal keratinocytes as a potential determinant of the switch from senescence to pre-transformation.

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