结构依据有效的磷酸化3大肠杆菌thymidylate的叠氮胸苷一磷酸激酶。

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李维,Ostermann N, Brundiers R,古蒂RS, Reinstein J,康拉德,是我

结构依据有效的磷酸化3大肠杆菌thymidylate的叠氮胸苷一磷酸激酶。

《美国国家科学院刊S a . 1998年11月24日,95 (24):14045 - 50。doi: 10.1073 / pnas.95.24.14045。

PubMed ID

9826650 (在PubMed

]

文摘

大肠杆菌的晶体结构thymidylate激酶(TmpK)在复杂的P1 - (5 ' -adenosyl) P5 - (5 ' -thymidyl) pentaphosphate和P1 (5 ' -adenosyl) P5 - (5 ' - (3 ' -azido-3 '脱氧胸苷)]pentaphosphate已经解决了2.0和2.2 a分辨率,分别。总体结构的细菌TmpK非常类似于酵母TmpK。与人类和酵母TmpKs,使磷酸化3‘-azido-3脱氧胸苷5 '一磷酸(AZT-MP) 200倍降低转化率(kcat)生理基质dTMP相比,减少kcat只是2倍的细菌酶。不同的动力学特性对AZT-MP真核TmpKs和大肠杆菌可以合理化TmpK这些酶稳定的不同方式假定过渡态和不同方式的羧酸侧链P环一磷酸脱氧核糖的交互。酵母TmpK交互与3 '羟基通过Asp-14 dTMP P循环的双齿的方式:绑定AZT-MP结果P转变的循环,以适应更大的取代基。在大肠杆菌TmpK Glu-12相应的残留物,它旁边的方式进行交互的3 '羟基dTMP。这种不同模式之间的互动P与三羧酸循环的取代基一磷酸脱氧核糖允许住宿的叠氮基组的大肠杆菌酶没有显著P循环运动。此外,尽管酵母酶使用Arg-15(甘氨酸在大肠杆菌)稳定过渡态,大肠杆菌似乎使用参数- 153从一个地区称为盖子。因此,绑定的AZT-MP酵母TmpK导致催化残基的转变,这对于细菌激酶,情况就不一样了。

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
(p1) - 5 ' -adenosyl p5 - (5 ' pentaphosphate -thymidyl)	胸苷激酶	蛋白质	大肠杆菌(应变K12)	未知的	配位体	细节