烟碱乙酰胆碱受体的分子识别:pi-cation交互的重要性。

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施密特JD Sharples CG,考德威尔WS

烟碱乙酰胆碱受体的分子识别:pi-cation交互的重要性。

J地中海化学。1999年8月12日,42 (16):3066 - 74。

PubMed ID

10447950 (在PubMed

]

文摘

我们探索的意义pi-cation交互绑定的烟碱乙酰胆碱受体的配体。具体来说,奥斯汀的半经验分子轨道理论方法是用来估计芳香族氨基酸侧链之间的相互作用与cation-containing杂环烟碱配体的碎片。变分交互能量(E (i))的一面显示chain-ligand片段对军事和遵循Morse-like势函数。色氨酸侧链显示最为明显与阳离子的交互片段,其次是酪氨酸和苯丙氨酸。对于给定的侧链,阳离子片段展示典型不同E (i)资料、与azabicyclo[2.2.1]庚烷片段的强有力的烟碱配体epibatidine引起最大的相互作用能,研究集。最重要的是,最低能量的值计算出无数碎片与父配体的亲和力——我们展示这个的理由heteropentameric(就是alpha4beta2)和homopentameric alpha7烟碱乙酰胆碱受体亚型。此外,分子间距离对应Morse-like潜在最低也与高亲和性绑定。大量的并行计算在达到这个?我从头开始的理论水平,以证实这些发现。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
尼古丁	神经乙酰胆碱受体亚基beta 2	Ki (nM)	4	N /一个	N /一个	细节