geranylgeranyl抑制二磷酸合酶磷酸盐:晶体和计算调查。

文章的细节

引用

复制到剪贴板

张km陈C, Hudock MP, Y,郭RT,曹R,没有JH,梁PH值,Ko TP, Chang TH, Chang SC,歌Y,阿克赛尔森J,库马尔,王啊,奥德菲尔德E

geranylgeranyl抑制二磷酸合酶磷酸盐:晶体和计算调查。

J地中海化学。2008年9月25日,51 (18):5594 - 607。doi: 10.1021 / jm800325y。

PubMed ID

18800762 (在PubMed

]

文摘

我们报告的x射线结构几个二磷酸盐geranylgeranyl二磷酸合成酶的抑制剂,抗癌药物的目标。磷酸盐含无支链的侧链结合的金合欢二磷酸(FPP)衬底网站的geranylgeranyl二磷酸(GGPP)产品的网站,在一个案例中,两个站点,二磷酸盐基相互作用3毫克(2 +)占据FPP合酶中发现的一样。然而,每个三个“v型”的磷酸盐结合FPP和GGPP网站。使用滑动程序,我们复制的绑定模式10磷酸盐均方根误差为1.3。活动的磷酸盐GGPPS抑制预测的总体误差2 x利用比较分子相似性分析基于docked-structure对齐。这些结果表明,一些GGPPS抑制剂可以占领衬底和产品网站和绑定模式以及活动可以准确地预测,促进GGPPS抑制剂作为抗癌药物的进一步发展。

beplay体育安全吗DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
(1-DIYL 1-HYDROXYHEPTANE-1 BIS(膦酸)	Geranylgeranyl焦磷酸合酶	集成电路50 (nM)	11220年	7	37	细节
(1-DIYL 1-HYDROXYNONANE-1 BIS(膦酸)	Geranylgeranyl焦磷酸合酶	集成电路50 (nM)	710年	7	37	细节
(2-DIPHOSPHONOETHYL)(十二烷基)DIMETHYLPHOSPHONIUM	Geranylgeranyl焦磷酸合酶	集成电路50 (nM)	One hundred.	7	37	细节
11 (6 e, e) -HEPTADECA-6 11-DIENE-9, 9-DIYLBIS(膦酸)	Geranylgeranyl焦磷酸合酶	集成电路50 (nM)	1860年	7	37	细节
[2 - (3-DIBENZOFURAN-4-YL-PHENYL) 1-hydroxy-1-phosphono-ethyl]膦酸	Geranylgeranyl焦磷酸合酶	集成电路50 (nM)	3980年	7	37	细节
月桂醇diphosphonic酸	Geranylgeranyl焦磷酸合酶	集成电路50 (nM)	2690年	7	37	细节
Zoledronic酸	Geranylgeranyl焦磷酸合酶	集成电路50 (nM)	100000年	7	37	细节