基于知识的识别缺氧选择性抑制剂使用基于药效团和结构的虚拟筛选模型。

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Boppana K, Dubey PK, Jagarlapudi SA Vadivelan年代,Rambabu G

基于知识的识别缺氧选择性抑制剂使用基于药效团和结构的虚拟筛选模型。

欧元J地中海化学。2009年9月,44 (9):3584 - 90。doi: 10.1016 / j.ejmech.2009.02.031。Epub 2009年3月11日。

PubMed ID

19321235 (在PubMed

]

文摘

单胺氧化酶B与已知的配体是调查使用基于药效团和结构相结合的建模方法。对接结果表明,药效团和对接模型是在良好的协议和用于识别选择性缺氧抑制剂。最好的模型,Hypo2包括三个药效团特征,即。,一个氢键受体,一个氢键供体和一个芳香环。Hypo2模型被用来屏幕内部的数据库80000个分子,导致5500种化合物。对接进行了研究,随后,在集群上的代表从5500种化合物530的点击量。基于结构新颖性和选择性指数,我们建议15选择性缺氧抑制剂为进一步合成和药理筛选。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Linezolid	胺氧化酶(flavin-containing) B	集成电路50 (nM)	17000年	N /一个	N /一个	细节
优降宁	胺氧化酶(flavin-containing) B	集成电路50 (nM)	2600年	N /一个	N /一个	细节