RAR和RXR受体配体识别:绑定和选择性。
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苏斯曼F, de Lera基于“增大化现实”技术
RAR和RXR受体配体识别:绑定和选择性。
J地中海化学。2005年10月6日,48 (20):6212 - 9。
- PubMed ID
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16190748 (在PubMed]
- 文摘
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基本的生物功能,尤其是embriogenesis,细胞生长,细胞分化,细胞凋亡,部分是由一个复杂的基因网络,开始绑定(激活)类维生素a的同源受体,核受体超家族的成员。我们学习了维生素a受体的配体识别(RXRalpha和RARgamma)使用molecular-mechanics-based对接方法。这项工作中所使用的协议能够排名为单个类维生素a对配体的亲和力受体,最高的值对应于那些更好的适应的形状结合位点并生成最优组静电和无极的与受体的相互作用。此外,我们的研究揭示到一些充满活力的贡献类维生素a受体配体选择性。在这方面我们表明,有一个极性的差异之间的结合位点区域锚RAR和RXR羧酸盐,将自身转化为大量的能量差异相同受体与配体的相互作用。我们观察到,后者能量变化是取消了溶剂化作用能量损失在绑定。这种能量补偿的实验也证实,解决RARgamma定点诱变对配体结合的影响。结合位点的不同极性的假设可以利用它们来构建RXR-selective配体测试和一些化合物有thiazolidinedione锚定组。