计算机建模的选择性地区一氧化氮合成酶的活性部位:暗示isoform-selective抑制剂的设计。

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李记H, H, Flinspach M, Poulos TL,西尔弗曼RB

计算机建模的选择性地区一氧化氮合成酶的活性部位:暗示isoform-selective抑制剂的设计。

J地中海化学。2003年12月18日,46(26):5700 - 11所示。

PubMed ID

14667223 (在PubMed

]

文摘

选择性抑制一氧化氮合酶(NOS)亚型有很大的治疗带来的潜在治疗某些疾病的病理生产过剩一氧化氮。在这项研究中三个结构的每个号同种型是用来检查选择性地区活跃的站点使用网格/ CPCA的方法。在网格计算,10探针覆盖疏水性,立体,hydrogen-bond-acceptor和捐赠者交互被用来计算分子间相互作用领域(mif)活性部位。残基的侧链的灵活性和网格间距被认为是在同一时间。一致的主成分分析(CPCA)应用于分析mif NOS亚型之间的活性位点的差异。通过结合抠图工具在电网/ CPCA pseudofield微分情节,几个选择性地区活性位点的识别。选择性的分析表明,最重要的决定因素NOS抑制剂选择性疏水和charge-charge交互。25号的抑制剂被停靠到使用程序AutoDock3.0活性部位。区域确定为重要的是该方法的选择性与抑制剂的结构活性关系的协议。合理使用选择性地区中描述这项工作应该可以开发NOS isoform-selective抑制剂。

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药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
L-N(ω)-Nitroarginine-2 4-L-diaminobutyric酰胺	一氧化氮合酶,大脑	Ki (nM)	330年	N /一个	N /一个	细节
L-N(ω)-Nitroarginine-2 4-L-diaminobutyric酰胺	内皮一氧化氮合酶	Ki (nM)	245000年	N /一个	N /一个	细节
N - {(4 s) 4-amino-5 - [(2-aminoethyl)氨基]戊烷基}- N硝基胍	一氧化氮合酶,大脑	Ki (nM)	290年	N /一个	N /一个	细节
N - {(4 s) 4-amino-5 - [(2-aminoethyl)氨基]戊烷基}- N硝基胍	内皮一氧化氮合酶	Ki (nM)	524000年	N /一个	N /一个	细节