在14的内部空腔的功能组蛋白deacetylase-like蛋白质:影响组蛋白脱乙酰酶抑制剂的设计。
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王DF,王寅O, Helquist P, Lan-Hargest HY, Wiech问
在14的内部空腔的功能组蛋白deacetylase-like蛋白质:影响组蛋白脱乙酰酶抑制剂的设计。
J地中海化学。2004年6月17日,47(13):3409 - 17所示。
- PubMed ID
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15189037 (在PubMed]
- 文摘
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组蛋白去乙酰酶抑制剂(hdac)基因转录中起着重要的作用。hdac抑制剂诱导细胞分化和抑制细胞增殖的肿瘤细胞。AutoDock计算已知的和小说HDAC抑制剂以及几个探针分子的组蛋白deacetylase-like蛋白质(HDLP),使用修改后的得分函数为金属离子,展示优秀的协议(R = 0.92)之间的实验和计算结合常数。对接结构允许的分析确定不同的绑定图案在已知的抑制剂。这样的计算是一个有用的工具,为新HDAC抑制剂结合常数的预测。勘探的14长内部空腔附近活跃的网站对接的小分子探针表明它起着至关重要的作用,通过接受醋酸裂解和释放的远侧腔。研究结果对设计的重要性的新抑制剂进行了探讨。
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药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C) Vorinostat 组蛋白脱乙酰酶1 集成电路50 (nM) 200年 N /一个 N /一个 细节