结构的起源在课堂上选择性II-selective组蛋白脱乙酰酶抑制剂。

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Estiu G,格林伯格E,哈里森CB, Kwiatkowski NP, Mazitschek R,他我,王寅O

结构的起源在课堂上选择性II-selective组蛋白脱乙酰酶抑制剂。

J地中海化学。2008年5月22日,51 (10):2898 - 906。doi: 10.1021 / jm7015254。Epub 2008年4月16日。

PubMed ID

18412327 (在PubMed

]

文摘

类的发展,isoform-selective组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂是非常可取的研究这些蛋白质转录调控中心之间复杂的相互作用,以及发展的选择性HDAC抑制剂药物表观遗传学。提供一个合理的设计结构基础的抑制剂,抑制的计算和实验研究相结合三个不同的组蛋白脱乙酰酶亚型,HDAC1, 6和8,三种不同的报告hydroxamate抑制剂。而萨哈被发现unselective I和II级hdac抑制类,另一个向二级hdac抑制剂被发现是有选择性的。分子动力学模拟表明这种选择性是由蛋白质的整体形状表面的活性部位和特定的相互作用导致天冬氨酸残基在极性环和两个苯丙氨酸和蛋氨酸在非极性的循环。监控特定的交互仿真时间的函数识别关键sulfur-pi交互。影响结构设计的主题类的II-selective HDAC抑制剂进行了讨论。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Vorinostat	组蛋白脱乙酰酶1	Ki (nM)	48	7.4	22	细节