设计、合成、对接、和生物评价小说diazide-containing异恶唑和pyrazole-based组蛋白脱乙酰酶探针。

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Neelarapu R, holzele DL Velaparthi年代,白H, Brunsteiner M,金发SY, Petukhov PA

设计、合成、对接、和生物评价小说diazide-containing异恶唑和pyrazole-based组蛋白脱乙酰酶探针。

J地中海化学。2011年7月14日,54 (13):4350 - 64。doi: 10.1021 / jm2001025。Epub 2011 6月2。

PubMed ID

21548582 (在PubMed

]

文摘

设计、合成、对接和生物评价小说有力HDAC3 HDAC8异恶唑和pyrazole-based diazide探测器适合绑定整体分析与光亲和标记(BEProFL)细胞实验。异恶唑-和pyrazole-based探针具有活性低摩尔抑制对HDAC3 HDAC8,分别。pyrazole-based探针3 f似乎是一个最活跃的HDAC8抑制剂在文献中报道的IC(50) 17海里。我们对接的研究表明,与isoxazole-based pyrazole-based配体配体是足够灵活,能够占领HDAC8第二结合位点。探针/抑制剂2 b, 3、3 c,和3 f施加抗增殖和神经活动在微摩尔的通过核hdac抑制浓度,表明它们是细胞渗透和叠氮化或diazide集团的存在不会干扰神经保护属性,或增强细胞的细胞毒性,细胞通透性的影响。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Trichostatin一	组蛋白脱乙酰酶7	集成电路50 (nM)	139年	N /一个	N /一个	细节
Vorinostat	组蛋白脱乙酰酶1	集成电路50 (nM)	22.37	N /一个	N /一个	细节
Vorinostat	组蛋白脱乙酰酶2	集成电路50 (nM)	One hundred.	N /一个	N /一个	细节
Vorinostat	组蛋白脱乙酰酶3	集成电路50 (nM)	27	N /一个	N /一个	细节