发现的一类小说non-ATP网站DFG-out状态p38抑制剂利用计算辅助虚拟fragment-based药物设计(vFBDD)。

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莫菲特K, Konteatis Z,阮D, Shetty R, Ludington J,藤本T,李KJ,柴X, Namboodiri H, Karpusas M,多尔西B, Guarnieri F, Bukhtiyarova M, Springman E, Michelotti E

发现的一类小说non-ATP网站DFG-out状态p38抑制剂利用计算辅助虚拟fragment-based药物设计(vFBDD)。

地中海Bioorg化学。2011年12月1;21 (23):7155 - 65。doi: 10.1016 / j.bmcl.2011.09.078。Epub 2011年9月28日。

PubMed ID

22014550 (在PubMed

]

文摘

发现一种新的DFG-out p38alpha激酶抑制剂没有铰链交互描述。计算辅助、虚拟fragment-based药物设计(vFBDD)平台是用来识别小说non-aromatic碎片使生产力氢键相互作用参数alphaC-helix 70。分子将这些碎片被发现是强有力的p38激酶的抑制剂。x射线co-crystal结构确认预测绑定模式。铅化合物被认定为有效的(p38alpha IC (50) = 22 nM)和高选择性(> / = 150倍150激酶面板)DFG-out p38激酶抑制剂。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Doramapimod	增殖蛋白激酶14	集成电路50 (nM)	20.	N /一个	N /一个	细节