活动景观地图建模与dual-activity PPAR配体的区别。

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Mendez-Lucio O, Perez-Villanueva J,卡斯蒂略R, Medina-Franco杰

活动景观地图建模与dual-activity PPAR配体的区别。

Bioorg医疗化学。2012年6月1;20 (11):3523 - 32。doi: 10.1016 / j.bmc.2012.04.005。Epub 2012年4月19日。

PubMed ID
22564380 (在PubMed
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激活过氧物酶体proliferator-activated受体(PPAR)子类型提供了一个有前途的战略治疗糖尿病和代谢疾病。选择性和双重PPAR激动剂开发和系统描述的结构活性关系(SAR)具有重大的意义。在此,我们报告一个系统描述SAR的168种化合物筛选对三PPAR亚型使用活动景观建模的原则。作为我们努力的一部分开发和应用chemoinformatic工具浏览活动景观,我们采用共识dual-activity地图最近报道的差异。效能差异的分析是基于成对关系和structure-similarity计算组合的四种不同的2 d和3 d结构表征。Dual-activity不同地图发现地区景观具有类似SAR两个或三个受体亚型以及逆SAR的地区,也就是说,改变结构,增加活动一个亚型,但减少活动对于其他亚型。分析对化合物的结构相似度高的披露存在的单,双,悬崖和“pan-receptor”活动,也就是说,小结构的改变,高效力的变化,两个,三个受体亚型,分别。单、双、啤酒花pan-receptor脚手架进行了讨论。选定的数据点的化学结构的分析本文报道指出特定的结构特点,对新PPAR激动剂的设计是很有帮助的。这项工作中提出的方法一般可以扩展到更大的数据集进行分析。

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绑定属性
药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C)
2 - {5 - [3 - (6-BENZOYL-1-PROPYLNAPHTHALEN-2-YLOXY)丙氧基]INDOL-1-YL}乙酸 过氧物酶体proliferator-activated受体γ 集成电路50 (nM) 50 N /一个 N /一个 细节
2 - {5 - [3 - (7-PROPYL-3-TRIFLUOROMETHYLBENZO [D] ISOXAZOL-6-YLOXY)丙氧基]INDOL-1-YL}乙酸 过氧物酶体proliferator-activated受体γ 集成电路50 (nM) 152.05 N /一个 N /一个 细节
Cardarine 过氧物酶体proliferator-activated受体α 集成电路50 (nM) 1995.26 N /一个 N /一个 细节
Cardarine 过氧物酶体proliferator-activated受体δ 集成电路50 (nM) 5 N /一个 N /一个 细节