同源建模使用多个分子动力学模拟和对接研究人类的雄激素受体配体结合域绑定到睾丸激素和非甾体类配体。

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Marhefka CA,摩尔BM 2日主教TC, Kirkovsky L,穆克吉,道尔顿JT,米勒弟弟

同源建模使用多个分子动力学模拟和对接研究人类的雄激素受体配体结合域绑定到睾丸激素和非甾体类配体。

J地中海化学。2001年5月24日,44 (11):1729 - 40。

PubMed ID

11356108 (在PubMed

]

文摘

促进小说的合理的设计和更强的雄激素受体配体,三维模型的人类雄激素受体配体结合域绑定到睾丸激素已经开发出来。这些模型的雄激素受体的晶体结构是基于人类高度同源的孕酮受体配体结合域。同源建模的雄激素受体精使用的多个分子动力学模拟在显式的溶剂。主要H-bonding伙伴17-hydroxy组和3-keto组的睾丸激素Asn705 Thr877,分别和Gln711 Arg752。这些模型显示独特的存在空置的空腔内的雄激素受体结合口袋里可能有价值的小说发展的选择性雄激素受体配体。一个定性分析hAR绑定口袋内的氨基酸突变影响配体结合与这些雄激素受体模型一致。除了睾酮,绑定模式的几个hydroxyflutamide-like非甾体类雄性激素受体配体进行了研究使用灵活的对接与FlexX紧随其后的是精致的初始复合物分子动力学模拟。这些对接的研究表明,在绑定hydroxyflutamide Asn705是一个重要的决定因素及其衍生物通过参与H-bond交互与阿尔法羟基这些配体的一部分。此外,硝基功能模拟3-keto群自然睾酮配体和参与Gln711和Arg752 H-bonding交互。从这些对接的研究中,我们建议一种机制的手性拆分绑定hydroxyflutamide衍生品和扩展先前报道hydroxyflutamide及其衍生物的构效关系。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
(R) 3-bromo-2-hydroxy-2-methyl-n - [4-NITRO-3 (TRIFLUOROMETHYL)苯基]丙酰胺	雄性激素受体	Ki (nM)	0.3	N /一个	N /一个	细节