特异性的胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶:loop-motion-controlled动态相关性作为一个行列式。
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唐马W, C,赖L
特异性的胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶:loop-motion-controlled动态相关性作为一个行列式。
Biophys j . 2005年8月,89 (2):1183 - 93。doi: 10.1529 / biophysj.104.057158。Epub 2005年5月27日。
- PubMed ID
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15923233 (在PubMed]
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胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶都是丝氨酸蛋白酶序列和结构相似性高,但在不同的底物特异性。先前的实验演示了两个循环的关键作用在控制绑定口袋外两种酶的特异性。理解的机制控制特异性的遥远的循环,我们使用高斯网络模型来研究胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶的动态属性和角色扮演的两个循环。介绍了聚类方法分析残留的相关动作。我们发现,胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶具有不同的动态签名两个循环区域,这反过来与运动的某些残留高度相关绑定的口袋。有意思的是,取代胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶的变化的两个循环chymotrypsin-like胰蛋白酶的运动风格,而同样的实验替代了必要使胰蛋白酶胰凝乳蛋白酶的酶特异性和活动。这些结果表明,两者的合作运动循环和substrate-binding网站导致胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶的活性和底物特异性。
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