描述蛋白酶特异性:我们需要多少基板?
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Fuchs Schauperl M,我,瓦尔德内尔BJ, Huber RG,克雷默C, Liedl KR
描述蛋白酶特异性:我们需要多少基板?
《公共科学图书馆•综合》。2015年11月11日,10 (11):e0142658。doi: 10.1371 / journal.pone.0142658。eCollection 2015。
- PubMed ID
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26559682 (在PubMed]
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乳沟熵的计算可以量化,地图和比较蛋白酶底物特异性的基于信息熵的方法。度量本质上取决于实验的数量确定基质(数据点)。因此其数值稳定性的统计分析是至关重要的估计的系统误差估计基于有限数量的底物特异性。在这个贡献,我们展示了数学基础在乳沟熵估计的不确定性。组解理熵计算极端情况下使用实验乳沟数据和建模。通过分析基础数学和应用统计工具,一个线性依赖性度量的1 / n被发现。这使我们能够推断值无限数量的样本,估计错误。分析错误,最小数量的30基质被发现有必要描述底物特异性,氨基酸的可变性,蛋白酶(S4-S4”)与5%的不确定性。因此,我们鼓励蛋白酶领域实验研究人员记录蛋白酶特异性的小说旨在识别至少30肽底物的最大序列多样性。我们期待一个完整的描述的蛋白酶特异性有助于理顺蛋白酶生物学功能的基础上,协助合理药物设计。
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