一种精确和大规模鉴定核心集中糖蛋白的策略。

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贾伟，陆震，付勇，王和辉，王海林，迟辉，袁泽峰，郑志斌，宋丽宁，韩海辉，梁玉明，王金林，蔡勇，张玉凯，邓玉玲，应文涛，何明敏，钱晓辉

一种精确和大规模鉴定核心集中糖蛋白的策略。

《Mol Cell Proteomics》2009年5月;8(5):913-23。doi: 10.1074 / mcp.M800504-MCP200。Epub 2009 1月12日。

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19139490 (PubMed视图

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摘要

一些糖蛋白的核心聚焦化(CF)模式在许多疾病(如癌症)的诊断中比评估其各自的总蛋白水平更敏感和特异性。CF糖蛋白的整体分析和定量表征可能为临床应用揭示强有力的生物标志物。然而，目前的技术还不能大规模精确地揭示CF糖蛋白。在这里，我们开发了一种稳健的策略，集成了分子量截断、中性损失依赖MS(3)、数据库独立的候选频谱过滤和优化，以有效地识别CF糖蛋白。光谱处理的基本原理是基于CF糖肽光谱中质量分布的计算。通过对健康受试者和肝细胞癌受试者血浆的实施，证明了这一策略的有效性。经鉴定的CF糖蛋白和CF位点超过100个，CF糖肽质谱超过10000个。鉴定结果的规模表明，在寻找具有独特和诱人前景的生物标志物方面取得了很大的进展，候选谱将为改进糖肽数据库检索方法提供有用的资源。

beplay体育安全吗引用本文的药物库数据

多肽

名字	UniProt ID
凝血酶原	P00734	细节
1型血管紧张素II受体	P30556	细节
多巴胺beta-hydroxylase	P09172	细节
钾电压门控通道亚家族H成员6	Q9H252	细节
Serotransferrin	P02787	细节
肝素辅因子2	P05546	细节
谷氨酰胺酶肾亚型，线粒体	O94925	细节
Alpha-2-macroglobulin	P01023	细节
Alpha-1-antitrypsin	P01009	细节
胰岛素样生长因子结合蛋白3	P17936	细节
膜一级胺氧化酶	Q16853	细节
E3泛素蛋白连接酶Mdm2	Q00987	细节
Kininogen-1	P01042	细节
冯·维勒布兰德因子	P04275	细节
Vitronectin	P04004	细节
细胞间粘附分子	P05362	细节
血浆铜蓝蛋白	P00450	细节
纤连蛋白	P02751	细节
纤维蛋白原γ链	P02679	细节
低密度脂蛋白受体相关蛋白1	Q07954	细节
胆碱酯酶	P06276	细节
血浆蛋白酶C1抑制剂	P05155	细节
Ig γ -1链C区	P01857	细节
Beta-2-glycoprotein 1	P02749	细节
Zinc-alpha-2-glycoprotein	P25311	细节
清道夫受体富半胱氨酸1型蛋白M130	Q86VB7	细节
Cadherin-5	P33151	细节
胆固醇酯转移蛋白	P11597	细节
Ig γ -2链C区	P01859	细节
蛋白酶体亚基-4型	P28070	细节
Ig α -2链C区	P01877	细节
补充C4-A	P0C0L4	细节
载脂蛋白D	P05090	细节
Ig γ -4链C区	P01861	细节
Ig α -1链C区	P01876	细节
C链区域	P01871	细节
硒蛋白P	P49908	细节
Afamin	P43652	细节
Alpha-2-HS-glycoprotein	P02765	细节
补体成分C9	P02748	细节
补体因子H	P08603	细节
补体因子I	P05156	细节
Clusterin	P10909	细节
富亮氨酸alpha-2-glycoprotein	P02750	细节
Kallistatin	P29622	细节
色素上皮衍生因子	P36955	细节
Ficolin-3	O75636	细节
胰蛋白酶间抑制剂重链H1	P19827	细节
免疫球蛋白J链	P01591	细节
一种具有血栓反应蛋白基序的分解素和金属蛋白酶	Q76LX8	细节
磷脂转移蛋白	P55058	细节
Prostaglandin-H2 D-isomerase	P41222	细节
血液结合素	P02790	细节
结合珠蛋白	P00738	细节
白细胞介素6受体亚单位	P40189	细节
Hyaluronidase-4	Q2M3T9	细节