人类HPRT基因座的自动DNA测序。
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Edwards A, Voss H, Rice P, Civitello A, Stegemann J, Schwager C, Zimmermann J, Erfle H, Caskey CT, Ansorge W
人类HPRT基因座的自动DNA测序。
基因组学。1990年4月;6(4):593-608。
- PubMed ID
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2341149 (PubMed视图］
- 摘要
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使用自动荧光DNA测序已经确定了57 kb的人类HPRT位点的完整序列。该策略越来越多地采用定向测序方法:随机生成的M13库被测序以生成连续重叠的序列集(contigs)。利用M13(通用型和反向型)和定制的寡核苷酸引物对这些contigs末端的M13克隆进行测序，完成测序项目。人类HPRT序列分别包括1676 bp 5'和15238 bp 3'到外显子1和9。该序列包含49个具有代表性的Alu重复序列，以及其他几种类型的重复序列。Alu序列具有偏位性，其前半段序列相对于基因转录呈负向(3'----5' = 77%，P < 0.005)，后半段序列随机定向(5'----3' = 67%，P < 0.5)。介绍了HPRT基因测序策略的发展和性能，以及人HPRT基因的特点。