三维解决方案的结构和骨架动态人类interleukin-3的变体。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
冯Y,克莱因BK, McWherter CA
三维解决方案的结构和骨架动态人类interleukin-3的变体。
J杂志。1996年6月14日,259 (3):524 - 41。
- PubMed ID
-
8676386 (在PubMed]
- 文摘
-
截断的三维结构和骨架动态和乘法代替重组人类interleukin-3 (IL-3)变体(sc - 65369)已经决定从多维异核核磁共振光谱数据。序贯应用距离几何和克制的分子动力学计算生产25收敛的家庭结构,满足1812实验约束(1659与质子间的不,75骨干二面角的约束,和39对氢键约束)平均均方根偏差意味着协调立场的0.88埃(+ / - 0.15)和1.37(+ / - 0.13)埃骨干和重原子,分别所有残留的除了28到39。结构是一个左撇子四螺旋束组成的螺旋a到D)和两个长反手循环(指定为循环AB和CD)。循环AB包含一个短第五螺旋(螺旋),对螺旋密集D在一个近似平行的时尚和有多个接触循环CD。整个分子下跌时间(6.5 ns)决定从15 n弛豫数据符合一个单体的蛋白质实验条件下(1毫米的蛋白质,pH值4.6,30摄氏度)。15 n放松sc - 65369年的数据表明,螺旋区域是相当严格的,而AB部分循环,循环CD,和C末端进行重大的内部运动。结构中相关four-helical束细胞因子,sc - 65369的结构是最类似于granulocyte-macrophage集落刺激因子(gm - csf)和单一结构域interleukin-5 (IL-5),所有这些都有一个共同的受体亚基所需造血靶细胞的信号转导和激活。事实上,C(α)原子四螺旋核心的这三种蛋白质可以叠加1.71埃(sc - 65369和gm - csf, 62 C(α)的原子)和1.96埃(sc - 65369和IL-5单结构域,58 C(α)的原子),分别。当IL-3的结构变异,gm - csf和IL-5对齐,守恒和保守替换残留物被发现是疏水性和埋葬,除Glu-22单一(IL-3编号),严格保守但完全暴露在溶剂。最引人注目的差异sc - 65369的结构和gm - csf发生在循环AB。这个循环在gm - csf十字架的螺旋D和通过下循环CD在螺旋b .相比之下,循环AB的sc - 65369通过螺旋D,类似于第一个交叉循环在人类生长激素和粒细胞集落刺激因子。此外,螺旋”,这是互相交叉螺旋束的方式类似于CD的螺旋循环β干扰素和移行细胞,存在于一个地区短的beta-structure在gm - csf和IL-5发现类似的职位。这些差异表明,结构元素在这个地区可能是重要的识别同源受体。