凝血因子IXa: Tyr99松弛构象阻断底物结合。
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Hopfner KP, Lang A, Karcher A, Sichler K, Kopetzki E, Brandstetter H, Huber R, Bode W, Engh RA
凝血因子IXa: Tyr99松弛构象阻断底物结合。
结构。1999 Aug 15;7(8):989-96。
- PubMed ID
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10467148 (PubMed视图］
- 摘要
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背景:在S1丝氨酸蛋白酶家族中，凝血因子IXa (fIXa)对合成肽底物是唯一低效的。诱变研究表明，S2-S4底物结合裂口上的残基环(99环)导致了低效率。猪fIXa与抑制剂d - ph - pro - arg -氯甲基酮(PPACK)配合物的晶体结构不能直接说明99环的作用，因为双重共价抑制剂诱导了fIXa的活性构象。结果:重组人fIXa与对氨基苯脒配合物双畴结构的晶体结构表明Tyr99侧链在缺乏底物相互作用的情况下呈非典型构象。在这种构象中，羟基占据了与正常结合底物P2残基的主链相对应的体积。为了适应衬底结合，Tyr99必须采用更高的能量构象来创建S2口袋并限制S4口袋，就像fIXa-PPACK中那样。能量成本可能是显色底物fIXa的低K(M)值的重要原因。在同源物中，如Xa因子和组织纤溶酶原激活剂，99环的不同构象使Tyr99处于结合态和非结合态的低能构象。结论:fIXa对底物的分子识别似乎是由99环对Tyr99的作用决定的。这与其他凝固酶相反，一般来说，残基99的化学性质决定了S2和S3-S4中的分子识别。 This dominant role on substrate interaction suggests that the 99-loop may be rearranged in the physiological fX activation complex of fIXa, fVIIIa, and fX.