分子间的相互作用在44 kDa interferon-receptor复杂的检测到非对称reverse-protonation和2 d NOESY。
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Schnur Nudelman我老Akabayov E,拜伦Z,利维R,徐Y,杨D,英语专家J
分子间的相互作用在44 kDa interferon-receptor复杂的检测到非对称reverse-protonation和2 d NOESY。
生物化学。2010年6月29日,49(25):5117 - 33所示。doi: 10.1021 / bi100041f。
- PubMed ID
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20496919 (在PubMed]
- 文摘
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I型干扰素(ifn)组成一个家庭的同源螺旋细胞因子发起强有力的抗病毒和抗增殖活动。所有I型干扰素绑定到一个共同的细胞表面受体组成的两个子单元,IFNAR1 IFNAR2,关联绑定的干扰素。我们研究分子间相互作用IFNAR2-EC并使用不对称IFNalpha2 reverse-protonation不同的复杂的组件和二维核NOESY。这种新方法揭示了与一个优秀的信噪比24新两个分子之间的分子间不尽管复杂的低浓度(0.25毫米)和它的高分子量(44 kDa)。顺序和侧链IFNAR2-EC转让和IFNalpha2二进制复杂的帮助将分子间不分配给相应的质子。的对接模型IFNAR2-EC-IFNalpha2复杂计算的基础上,本研究中的分子间的相互作用以及四双突变体周期限制,以前观察到的不一双单残留和NMR之间的映射绑定网站IFNAR2-EC IFNalpha2。我们的对接模型双打前埋的表面积模型和显著增加分子间氢键的数量,盐桥和范德瓦耳斯相互作用。此外,我们的模型揭示了一些新的地区参与等结合位点的n端和一个螺旋IFNalpha2和C IFNAR2-EC领域。由于这些添加的方向相对于IFNalpha2 IFNAR2-EC改变了30度与以前相比计算模型,该模型是基于NMR映射结合位点和双突变体周期的约束。此外,新模型强烈支持最近提出的变构的变化IFNalpha2 IFNAR1-EC二进制IFNalpha2-IFNAR2-EC复杂的绑定。