横纹肌肉瘤细胞的转录组和蛋白质组学分析揭示了微分细胞基因表达在71年应对肠病毒感染。

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梁WF, Chow VT

横纹肌肉瘤细胞的转录组和蛋白质组学分析揭示了微分细胞基因表达在71年应对肠病毒感染。

细胞Microbiol。2006年4月,8 (4):565 - 80。

PubMed ID

16548883 (在PubMed

]

文摘

洞察宿主抗病毒策略以及病毒性疾病表现可以通过主机的说明——和virus-mediated转录反应。oligo-based微阵列来分析mrna的横纹肌肉瘤细胞感染女士/ 7423/87的肠道病毒71 (EV71)在20小时后感染。使用敏度软件和洛斯正常化,发现了152个基因表达下调而39被大于双重的调节。细胞骨架的改变记录包括编码组件、蛋白质翻译和修改;细胞运输蛋白质;蛋白质降解介质;细胞死亡介质;mitochondrial-related和蛋白质代谢;细胞受体和信号转换器。15个代表基因表达谱的变化验证了实时逆转录聚合酶链反应(rt - pcr),也比较了转录反应的细胞感染罪EV71毒株5865 / / 000009隔绝在2000年新加坡爆发致命的情况。 Western blot analyses of APOB, CLU, DCAMKL1 and ODC1 proteins correlated protein and transcript levels. Two-dimensional proteomic maps highlighted differences in expression of cellular proteins (CCT5, CFL1, ENO1, HSPB1, PSMA2 and STMN1) following EV71 infection. Expression of several apoptosis-associated genes was modified, coinciding with apoptosis attenuation observed in poliovirus infection. Interestingly, doublecortin and CaM kinase-like 1 (DCAMKL1) involved in brain development, was highly expressed during infection. Thus, microarray, real-time RT-PCR and proteomic analyses can elucidate the global view of the numerous and complex cellular responses that contribute towards EV71 pathogenesis.

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多肽

的名字	UniProt ID
鸟氨酸脱羧酶	P11926	细节
毒蕈碱的乙酰胆碱受体平方米	P08172	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶6	Q00534	细节
热休克蛋白beta 1	P04792	细节
蛋白酶体亚基α2型	P25787	细节
Cofilin-1	P23528	细节
主动脉平滑肌肌动蛋白	P62736	细节
Alpha-enolase	P06733	细节
Translationally-controlled肿瘤蛋白质	P13693	细节
Clusterin	P10909	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶DCLK1	O15075	细节
载脂蛋白b - 100	P04114	细节