人神经元甘氨酸受体α 1亚基扩展的第二跨膜域的核磁共振结构和骨干动力学。
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尤什曼诺夫VE，曼达尔PK，刘震，唐鹏，徐勇
人神经元甘氨酸受体α 1亚基扩展的第二跨膜域的核磁共振结构和骨干动力学。
生物化学，2003年4月8日;42(13):3989-95。
- PubMed ID
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12667090 (PubMed视图]
- 摘要
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用(1)H和(15)N溶液态NMR研究了十二烷基硫酸钠胶束中人神经元甘氨酸受体α(1)亚基第二跨膜段(TM2e)的结构和主链动力学。该28个氨基酸段包含共识的TM2结构域以及第二和第三跨膜结构域之间的部分连接子。从质子化学位移和中程核Overhauser效应(NOE)的模式可以明显看出，连接子附近存在一个至少13个氨基酸长的结构良好的螺旋区域和一个非结构区域。(15)N弛豫速率常数R(1)、R(2)和(15)N-[(1)H] NOE表明螺旋区内部运动受限，NOE值在0.6 ~ 0.8之间。使用无模型方法计算了所有TM2e骨干N-H键的平方阶参数(S(2))、快速内部运动的有效相关时间(tau(e))和全局旋转相关时间(tau(m))。螺旋区大部分残基的S(2)值在0.75-0.8beplayapp6之间，tau(e)值低于100 ps。由螺旋区动力学计算得到的tau(m)值为5.1 ns。S(2)值下降到0.1,tau(e)值急剧上升到1.2 ns，表明该区域的运动是不受限制的。结果表明，TM2e在胶束中具有较高的运动自由度，跨膜结构域的N端和c端部分具有不同的倾向，可以形成稳定的螺旋结构。