耐甲氧西林金黄色葡萄球菌全基因组测序。
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黑田m，太田t，内山I, Baba T，汤泽H，小林I，崔L，大口A，青木K，永井Y，连J，伊藤T，金森M，松丸H，丸山A，村上H，细山A，水谷ui Y，高桥NK，佐野T，井上R，海东C，关水K，平川H，久原S，后藤S，矢崎J，金内久M，山下A，大岛K，古屋K，吉野C，柴部T，服部M，小笠原N，林林H，平松K
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌全基因组测序。
《柳叶刀》2001年4月21日;357(9264):1225-40。
- PubMed ID
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11418146 (PubMed视图]
- 摘要
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背景:金黄色葡萄球菌是社区获得性和医院获得性感染的主要原因之一。它产生许多毒素，包括超级抗原，导致独特的疾病实体，如中毒性休克综合征和葡萄球菌猩红热，并获得了对几乎所有抗生素的耐药性。全基因组分析是未来发展对抗这种生物的对策的必要步骤。方法:采用散弹枪随机测序法测定两株相关金黄色葡萄球菌N315和Mu50的全基因组序列。N315是1982年分离出的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)菌株，Mu50是1997年分离出的耐万古霉素MRSA菌株。使用GAMBLER和GLIMMER程序识别开放阅读框，并通过BLAST同源性搜索、motif分析和蛋白质定位预测对每个阅读框进行注释。结果:葡萄球菌基因组由复杂的基因混合物组成，其中许多似乎是通过横向基因转移获得的。大多数耐药基因通过质粒或移动遗传元件(包括一个独特的耐药岛)携带。在基因组中发现了三类新的致病性岛:毒性休克综合征毒素岛家族、外毒素岛和肠毒素岛。在后两个致病性岛中，发现外毒素和肠毒素基因簇与其他编码假定致病因子的基因簇紧密相连。 The analysis also identified 70 candidates for new virulence factors. INTERPRETATION: The remarkable ability of S aureus to acquire useful genes from various organisms was revealed through the observation of genome complexity and evidence of lateral gene transfer. Repeated duplication of genes encoding superantigens explains why S aureus is capable of infecting humans of diverse genetic backgrounds, eliciting severe immune reactions. Investigation of many newly identified gene products, including the 70 putative virulence factors, will greatly improve our understanding of the biology of staphylococci and the processes of infectious diseases caused by S aureus.